Project: | TL_step0-01A |
High resolution diffraction limits: | 1.80 Å, 1.79 Å, 1.78 Å, 1.77 Å, 1.76 Å, 1.75 Å, 1.74 Å, 1.73 Å, 1.72 Å, 1.71 Å, 1.70 Å, 1.69 Å, 1.68 Å, 1.67 Å, 1.66 Å, 1.65 Å, 1.64 Å, 1.63 Å, 1.62 Å, 1.61 Å, 1.60 Å, 1.59 Å, 1.58 Å, 1.57 Å, 1.56 Å, 1.55 Å, 1.54 Å, 1.53 Å, 1.52 Å, 1.51 Å, 1.50 Å, 1.49 Å, 1.48 Å, 1.47 Å, 1.46 Å, 1.45 Å, 1.44 Å, 1.43 Å, 1.42 Å, 1.41 Å, 1.40 Å, 1.39 Å, 1.38 Å, 1.37 Å, 1.36 Å, 1.35 Å, 1.34 Å, 1.33 Å, 1.32 Å, 1.31 Å |
Initial structure model: | 3n21_edit05_refmac1.pdb |
Merged diffraction data: | AUTOMATIC_DEFAULT_free_R.mtz |
Unmerged diffraction data: | AUTOMATIC_DEFAULT_scaled_unmerged.mtz |
Data with FreeRflag set 0 will be excluded during refinement. |
Working directory: | /public/pairef_datasets/publication_examples/3-2_TL/pairef_TL_step0-01A |
Run date and time: | 2020-05-26 13:00:04 |
user@host: | maly@localhost |
PAIREF version: | 1.1.0 |
REFMAC5 version: | 5.8.0258 |
Python version and executable: | 2.7.15 /protein2/phenix/phenix-1.16-3546/build/../conda_base/bin/python2.7 |
matplotlib version: | 2.2.3 |
# Shell Rwork(init) Rwork(fin) Rwork(diff) Rfree(init) Rfree(fin) Rfree(diff) 1.80A->1.79A 0.1580 0.1579 -0.0001 0.1954 0.1964 0.0010 1.79A->1.78A 0.1581 0.1583 0.0002 0.1964 0.1961 -0.0003 1.78A->1.77A 0.1585 0.1587 0.0002 0.1963 0.1958 -0.0005 1.77A->1.76A 0.1588 0.1590 0.0002 0.1956 0.1957 0.0001 1.76A->1.75A 0.1594 0.1594 0.0000 0.1960 0.1950 -0.0010 1.75A->1.74A 0.1598 0.1599 0.0001 0.1948 0.1948 0.0000 1.74A->1.73A 0.1602 0.1604 0.0002 0.1946 0.1945 -0.0001 1.73A->1.72A 0.1607 0.1610 0.0003 0.1948 0.1944 -0.0004 1.72A->1.71A 0.1614 0.1614 0.0000 0.1946 0.1946 0.0000 1.71A->1.70A 0.1618 0.1619 0.0001 0.1949 0.1949 0.0000 1.70A->1.69A 0.1623 0.1623 0.0000 0.1948 0.1947 -0.0001 1.69A->1.68A 0.1627 0.1627 0.0000 0.1951 0.1950 -0.0001 1.68A->1.67A 0.1632 0.1634 0.0002 0.1949 0.1951 0.0002 1.67A->1.66A 0.1635 0.1637 0.0002 0.1958 0.1960 0.0002 1.66A->1.65A 0.1641 0.1645 0.0004 0.1960 0.1961 0.0001 1.65A->1.64A 0.1653 0.1654 0.0001 0.1973 0.1968 -0.0005 1.64A->1.63A 0.1659 0.1657 -0.0002 0.1975 0.1972 -0.0003 1.63A->1.62A 0.1661 0.1663 0.0002 0.1980 0.1977 -0.0003 1.62A->1.61A 0.1668 0.1670 0.0002 0.1982 0.1980 -0.0002 1.61A->1.60A 0.1675 0.1675 0.0000 0.1984 0.1981 -0.0003 1.60A->1.59A 0.1679 0.1681 0.0002 0.1986 0.1983 -0.0003 1.59A->1.58A 0.1685 0.1685 0.0000 0.1991 0.1987 -0.0004 1.58A->1.57A 0.1691 0.1690 -0.0001 0.1993 0.1992 -0.0001 1.57A->1.56A 0.1696 0.1697 0.0001 0.1998 0.1996 -0.0002 1.56A->1.55A 0.1703 0.1704 0.0001 0.2003 0.2002 -0.0001 1.55A->1.54A 0.1709 0.1710 0.0001 0.2008 0.2007 -0.0001 1.54A->1.53A 0.1716 0.1717 0.0001 0.2013 0.2010 -0.0003 1.53A->1.52A 0.1724 0.1723 -0.0001 0.2017 0.2015 -0.0002 1.52A->1.51A 0.1730 0.1732 0.0002 0.2022 0.2019 -0.0003 1.51A->1.50A 0.1738 0.1737 -0.0001 0.2024 0.2023 -0.0001 1.50A->1.49A 0.1743 0.1744 0.0001 0.2032 0.2034 0.0002 1.49A->1.48A 0.1749 0.1749 0.0000 0.2042 0.2042 0.0000 1.48A->1.47A 0.1754 0.1755 0.0001 0.2046 0.2047 0.0001 1.47A->1.46A 0.1761 0.1762 0.0001 0.2051 0.2048 -0.0003 1.46A->1.45A 0.1765 0.1767 0.0002 0.2054 0.2054 0.0000 1.45A->1.44A 0.1771 0.1771 0.0000 0.2061 0.2057 -0.0004 1.44A->1.43A 0.1776 0.1776 0.0000 0.2062 0.2063 0.0001 1.43A->1.42A 0.1780 0.1782 0.0002 0.2070 0.2071 0.0001 1.42A->1.41A 0.1799 0.1801 0.0002 0.2078 0.2074 -0.0004 1.41A->1.40A 0.1803 0.1805 0.0002 0.2081 0.2078 -0.0003 1.40A->1.39A 0.1807 0.1809 0.0002 0.2085 0.2082 -0.0003 1.39A->1.38A 0.1810 0.1812 0.0002 0.2088 0.2085 -0.0003 1.38A->1.37A 0.1814 0.1815 0.0001 0.2089 0.2087 -0.0002 1.37A->1.36A 0.1816 0.1819 0.0003 0.2094 0.2090 -0.0004 1.36A->1.35A 0.1822 0.1824 0.0002 0.2101 0.2096 -0.0005 1.35A->1.34A 0.1826 0.1828 0.0002 0.2102 0.2100 -0.0002 1.34A->1.33A 0.1832 0.1835 0.0003 0.2107 0.2105 -0.0002 1.33A->1.32A 0.1837 0.1839 0.0002 0.2114 0.2111 -0.0003 1.32A->1.31A 0.1840 0.1843 0.0003 0.2119 0.2115 -0.0004
Note: For each incremental step of resolution from X->Y, the R-values were calculated at resolution X.
Raw data: TL_step0-01A_merging_stats.csv
#shell d_max d_min #obs #uniq mult. %comp <I> <I/sI> r_mrg r_meas r_pim cc1/2 cc_ano cc* 01 67.79 4.77 125941 1831 68.78 100.00 26.5 56.8 0.071 0.072 0.008 1.000 0.704 1.0000 02 4.77 3.37 232091 3108 74.68 99.97 28.4 56.4 0.088 0.089 0.010 1.000 0.503 1.0000 03 3.37 2.75 301747 3938 76.62 99.92 11.7 33.1 0.150 0.151 0.017 0.999 0.355 0.9997 04 2.75 2.38 342932 4589 74.73 99.59 5.0 19.5 0.255 0.257 0.029 0.997 0.231 0.9992 05 2.38 2.13 396759 5102 77.77 99.20 2.8 13.4 0.379 0.381 0.042 0.994 0.147 0.9985 06 2.13 1.94 427018 5775 73.94 98.79 1.5 8.4 0.595 0.599 0.068 0.986 0.049 0.9965 07 1.94 1.80 455635 5900 77.23 98.38 0.6 4.8 1.040 1.046 0.117 0.965 0.052 0.9911 08 1.80 1.79 36615 492 74.42 98.20 0.5 3.7 1.284 1.293 0.148 0.434 0.046 0.7780 09 1.79 1.78 35770 493 72.56 98.40 0.4 3.3 1.457 1.467 0.169 0.917 -0.049 0.9781 10 1.78 1.77 36874 525 70.24 97.58 0.4 3.2 1.531 1.541 0.181 0.902 -0.018 0.9739 11 1.77 1.76 39141 530 73.85 98.15 0.4 2.9 1.610 1.620 0.185 0.904 0.054 0.9745 12 1.76 1.75 39987 526 76.02 98.50 0.3 2.8 1.792 1.804 0.203 0.884 0.052 0.9687 13 1.75 1.74 42053 547 76.88 97.16 0.3 2.7 1.846 1.857 0.208 0.771 -0.061 0.9331 14 1.74 1.73 42518 561 75.79 98.59 0.3 2.5 1.969 1.982 0.223 0.871 0.065 0.9649 15 1.73 1.72 43650 565 77.26 97.25 0.3 2.4 2.057 2.070 0.231 0.872 -0.002 0.9652 16 1.72 1.71 44009 589 74.72 98.00 0.3 2.3 2.053 2.066 0.235 0.793 0.034 0.9405 17 1.71 1.70 43189 607 71.15 97.90 0.2 2.1 2.172 2.187 0.256 0.852 -0.046 0.9592 18 1.70 1.69 42890 619 69.29 97.63 0.2 2.0 2.299 2.316 0.275 0.591 0.009 0.8619 19 1.69 1.68 45645 619 73.74 98.41 0.2 1.8 2.537 2.555 0.293 0.801 0.020 0.9431 20 1.68 1.67 49405 656 75.31 96.76 0.2 1.9 2.464 2.481 0.281 0.840 0.119 0.9555 21 1.67 1.66 49113 656 74.87 98.50 0.2 1.8 2.681 2.699 0.306 0.770 0.001 0.9328 22 1.66 1.65 49952 656 76.15 96.90 0.2 1.8 2.685 2.703 0.305 0.751 0.015 0.9262 23 1.65 1.64 53812 701 76.76 97.91 0.2 1.5 2.959 2.979 0.335 0.299 0.026 0.6785 24 1.64 1.63 54533 712 76.59 97.14 0.2 1.5 3.024 3.044 0.341 0.734 0.009 0.9201 25 1.63 1.62 56096 723 77.59 97.31 0.1 1.4 3.252 3.272 0.365 0.690 -0.004 0.9036 26 1.62 1.61 57417 738 77.80 97.36 0.1 1.4 3.396 3.417 0.380 0.716 -0.040 0.9135 27 1.61 1.60 58799 751 78.29 97.03 0.1 1.3 3.641 3.663 0.406 0.682 -0.019 0.9005 28 1.60 1.59 58496 780 74.99 97.50 0.1 1.1 3.805 3.830 0.435 0.640 0.079 0.8835 29 1.59 1.58 57573 813 70.82 97.13 0.1 1.0 4.008 4.036 0.472 0.684 0.051 0.9013 30 1.58 1.57 54558 786 69.41 96.09 0.1 1.0 4.338 4.369 0.516 0.577 0.027 0.8554 31 1.57 1.56 55490 832 66.69 96.18 0.1 0.9 4.444 4.478 0.539 0.539 0.003 0.8369 32 1.56 1.55 53622 826 64.92 94.40 0.1 0.8 4.991 5.030 0.614 0.533 -0.015 0.8339 33 1.55 1.54 52871 844 62.64 94.20 0.1 0.7 5.107 5.148 0.640 0.437 -0.094 0.7799 34 1.54 1.53 48072 879 54.69 92.72 0.1 0.6 5.524 5.575 0.728 0.366 0.007 0.7320 35 1.53 1.52 46452 869 53.45 90.24 0.1 0.5 5.701 5.757 0.761 0.092 -0.033 0.4105 36 1.52 1.51 43236 826 52.34 84.72 0.1 0.5 5.924 5.983 0.799 0.246 -0.062 0.6284 37 1.51 1.50 40260 798 50.45 78.78 0.1 0.5 6.125 6.187 0.839 0.409 -0.001 0.7619 38 1.50 1.49 38487 788 48.84 77.56 0.1 0.3 7.429 7.507 1.032 0.178 -0.063 0.5497 39 1.49 1.48 36249 765 47.38 71.50 0.1 0.3 7.327 7.408 1.038 0.122 0.036 0.4663 40 1.48 1.47 34989 759 46.10 69.89 0.1 0.3 7.769 7.858 1.117 -0.025 0.033 N/A 41 1.47 1.46 32410 726 44.64 65.17 0.0 0.2 9.563 9.673 1.390 0.125 0.065 0.4714 42 1.46 1.45 31492 728 43.26 62.76 0.0 0.1 10.949 11.080 1.619 0.078 0.036 0.3804 43 1.45 1.44 29003 719 40.34 60.83 0.0 0.2 9.949 10.077 1.527 0.073 0.014 0.3689 44 1.44 1.43 26432 671 39.39 56.06 0.0 0.1 10.691 10.833 1.665 -0.004 -0.094 N/A 45 1.43 1.42 25371 665 38.15 53.93 0.0 0.0 13.304 13.484 2.113 0.077 0.143 0.3781 46 1.42 1.41 23915 672 35.59 50.95 0.0 0.1 13.498 13.696 2.229 -0.022 0.034 N/A 47 1.41 1.40 21639 646 33.50 49.50 0.0 -0.0 17.163 17.429 2.925 -0.016 -0.061 N/A 48 1.40 1.39 18831 624 30.18 45.88 0.0 -0.0 18.567 18.887 3.356 0.103 0.059 0.4322 49 1.39 1.38 16253 597 27.22 43.48 0.0 -0.0 16.437 16.750 3.134 0.028 0.027 0.2334 50 1.38 1.37 14483 593 24.42 41.18 0.0 -0.1 23.133 23.626 4.666 0.043 -0.021 0.2871 51 1.37 1.36 12206 570 21.41 38.59 -0.0 -0.1 22.931 23.490 4.955 0.022 0.137 0.2075 52 1.36 1.35 9737 536 18.17 34.99 -0.0 -0.1 39.410 40.557 9.278 -0.038 0.074 N/A 53 1.35 1.34 6947 500 13.89 32.01 -0.0 -0.1 19.814 20.577 5.335 0.049 -0.048 0.3057 54 1.34 1.33 3920 409 9.58 25.22 0.0 -0.0 14.650 15.501 4.859 -0.048 0.066 N/A 55 1.33 1.32 1574 266 5.92 16.57 0.0 -0.1 15.335 16.857 6.633 0.025 0.054 0.2209 56 1.32 1.31 170 59 2.88 6.67 0.0 -0.1 19.395 24.160 13.907 0.040 -0.079 0.2774